Alors que la numérisation des soins de santé devient de plus en plus importante, les scientifiques, les médecins et les chercheurs doivent essayer de décrypter les données qui n’ont jamais été vues auparavant afin de fournir les bons soins. La quantité d’informations dont disposent ces experts dépasse leur capacité de consommation et d’analyse. AmazoneLa cellule cloud s’est efforcée de fermer cet espace.
Amazon a récemment lancé des services Web de disponibilité générale pour Amazon Omics, qui aident les chercheurs à stocker et à analyser des données omiques telles que des séquences d’ADN, d’ARN et de protéines. Le service fournit aux clients l’infrastructure dont ils ont besoin pour donner un sens à de grandes quantités de données afin qu’ils puissent passer plus de temps à faire de nouvelles sciences.
AWS génère une grande partie des revenus d’Amazon, générant 20,5 milliards de dollars au troisième trimestre. L’activité de cloud computing s’est développée en santé, et même si AWS n’affiche pas de revenus pour certains services, la taille du marché mondial de l’analyse de données atteindra 2,15 milliards d’ici 2030, selon un rapport de Straits Research.
Le Dr Taha Kass-Hout, directeur de la santé chez AWS, a déclaré que la plupart des données de santé ne sont pas générées dans l’environnement, ce qui signifie que 97 % d’entre elles ne sont pas utilisées. Trier et interpréter ces informations est un défi, en particulier lorsque les chercheurs collectent des données omiques auprès de milliers de patients.
Avant son passage chez Amazon, Kass-Hout a servi deux mandats sous le président Barack Obama et a été la première directrice des informations sur la santé à la Food and Drug Administration des États-Unis.
Un génome humain peut stocker entre 80 et 150 gigaoctets, a déclaré Kass-Hout, et certains projets de recherche impliquent des pétaoctets et des exaoctets d’informations génomiques.
“Vous parlez de neuf Harry Potter si vous voulez imprimer sur une imprimante”, a déclaré Kass-Hout à CNBC. “Et c’est seulement pour les humains.”
Amazon Omics aide les chercheurs à organiser leurs données en fournissant trois catégories qu’ils peuvent utiliser indépendamment ou individuellement. Le stockage d’objets compatible Omics aide les chercheurs à stocker et à partager des données de séquence brutes ; Les flux de travail Omics activent les flux de travail qui traitent les données de séquence brutes à grande échelle ; et Omics Analytics simplifient les sorties de traitement de séquence.
Plus d’une douzaine de clients et partenaires ont testé une version bêta du service et utilisent Amazon Omics.
Pour Jeffrey Pennington, directeur des informations sur la recherche à l’hôpital pour enfants de Philadelphie, l’impact de cela est clair.
Pennington travaille au Département d’informatique biomédicale et de la santé, qui utilise les données et la technologie pour résoudre les problèmes de santé pédiatriques. Il a déclaré que l’agence avait passé cinq ans à étendre l’infrastructure pour analyser les données omiques, et maintenant ce n’est plus quelque chose à créer ou à maintenir.
“Nous sommes un grand centre médical pédiatrique universitaire, mais nous ne sommes pas assez grands pour apprendre et construire tout ce qui est nécessaire pour utiliser efficacement les données omiques”, a déclaré Pennington. “Notre temps et notre énergie, notre énergie, nos finances sont mieux utilisées pour assembler le puzzle que pour produire ces pièces en premier lieu.”
Amazon Omics stimule également la collaboration entre de grands groupes de recherche, de petits groupes cliniques et des sociétés de renseignement et pharmaceutiques, a déclaré Boris Oklander, co-fondateur et directeur de la technologie de C2i Genomics.
C2i est une société de biotechnologie qui travaille à utiliser les données génétiques pour développer des traitements personnalisés contre le cancer. Oklander a déclaré que la société avait rejoint la version bêta d’Amazon Omics après avoir tenté de développer sa propre technologie d’analyse de données.
Il a déclaré qu’Amazon Omics a créé un écosystème collaboratif qui élimine le besoin pour les chercheurs de créer des technologies complexes à partir de zéro.
“Nous ne faisons que démocratiser”, a-t-il déclaré. “Ce type de service est possible [us] pour débloquer la valeur des investissements réalisés par différents acteurs dans ce domaine.”
D’autres grandes entreprises technologiques ont développé des dispositifs similaires. MicrosoftAzure, la plateforme de cloud computing Azure, a lancé Microsoft Genomics en 2018 pour aider les chercheurs à interpréter les données générées par les technologies génomiques. GoogleLa technologie Cloud Life Sciences permet aux chercheurs de traiter de grandes données biologiques.
Pennington a noté que le Broad Institute et DNAnexus offrent également des services d’analyse de données génomiques populaires, mais a déclaré qu’ils sont difficiles à maintenir et ont moins de types de données qu’ils ne le peuvent avec Amazon Omics.
Compte tenu de la nature sensible et approfondie des données omiques, Kass-Hout a déclaré que la protection de la vie privée et des données des patients est une « évidence » pour AWS. Il a déclaré qu’AWS utilise plus de 300 services de sécurité, de conformité et de gestion et prend en charge 98 normes de sécurité et certifications de conformité. Ce faisant, AWS va au-delà de la conformité, a déclaré Kass-Hout, et fournit également à ses clients les meilleures ressources et outils de chiffrement.
Les clients sont également responsables de la création d’applications sécurisées au-dessus des services Amazon Omics, empêchant AWS de voir ou d’utiliser les données.
Kass-Hout a déclaré qu’Amazon Omics servira finalement de moyen d’organiser correctement les informations afin que les chercheurs puissent se concentrer sur les progrès de la vraie médecine.
“Bien que la dernière décennie de numérisation ait affecté l’industrie des sciences de la santé et de la vie, je crois fermement que la prochaine décennie consistera à interpréter ces données d’une manière qui est maintenant. [where] nous trouverons de nouveaux médicaments, de nouveaux diagnostics, des médicaments plus ciblés », a-t-il déclaré.
